Die Masterarbeit kann in einem der Unterrichtsfächer oder auf Antrag im Fach Bildungswissenschaften angefertigt werden. Für die Zulassung zur Masterarbeit im Fach Biologie werden mind. 15 CP in diesem Fach sowie das abgeschlossene Praxissemester vorausgesetzt. Sie schlagen zusammen mit Ihrer Erstgutachterin / Ihrem Erstgutachter (siehe Prüferliste unter „Formulare / Merkblätter / Prüferlisten“) ein Thema vor und melden die Arbeit im Prüfungsamt an. Für die Zweitgutachterin / den Zweitgutachter besteht ebenfalls ein Vorschlagsrecht. 
Falls Sie mit Auflagen zum M.Ed.-Studium zugelassen wurden, müssen Sie bei der Anmeldung zur Masterarbeit nachweisen, dass Sie alle Auflagen erfüllt haben.
Für die Masterarbeit werden 17 CP vergeben. Die Bearbeitungszeit für die Masterarbeit beträgt drei Monate. Bei einem empirischen oder experimentellen Thema kann die Bearbeitungszeit fünf Monate betragen, sofern der Arbeitsaufwand von 17 Kreditpunkten nicht überschritten wird. Die Masterarbeit soll einen Umfang von 170.000 Zeichen nicht überschreiten. Die Master-Arbeit ist im Studienfach Biologie nur als Einzelarbeit zulässig. Das Thema kann nur einmal und nur innerhalb von drei Wochen nach Beginn der Bearbeitungszeit zurückgegeben werden. Die Masterarbeit kann nur einmal wiederholt werden. Näheres regelt die Gemeinsame Prüfungsordnung in § 25 (GPO 2020). Im Fach Biologie ist die Arbeit in elektronischer Form (pdf oder pdfA) über das Online-Portal Sumit-Exam (s.u.) einzureichen. Beiden Gutachter/innen muss auf Wunsch je ein Druckexemplar ausgehändigt werden. In die Arbeit muss eine Selbstständigkeitserklärung (Textvorgabe unter „Formulare / Merkblätter / Prüferlisten“) eingebunden werden.